feat: Implement hybrid MPI+OpenMP parallelization
- Enable -qopenmp in makefile.inc - Add OpenMP directives to 4th order derivatives in diff_new.f90 - Update makefile_and_run.py to dynamic calculate OMP_NUM_THREADS based on 96 cores and remove hardcoded CPU binding
This commit is contained in:
@@ -69,6 +69,7 @@
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fy = ZEO
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fz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -151,6 +152,7 @@
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fx = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -218,6 +220,7 @@
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fy = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -282,6 +285,7 @@
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fz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -371,6 +375,7 @@
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fxz = ZEO
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fyz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -469,6 +474,7 @@
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fxx = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -531,6 +537,7 @@
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fyy = ZEO
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@@ -594,6 +601,7 @@
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fzz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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@@ -657,6 +665,7 @@
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fxy = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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@@ -719,6 +728,7 @@
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fxz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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@@ -780,6 +790,7 @@
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fyz = ZEO
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@@ -866,6 +877,7 @@
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fxz = ZEO
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fyz = ZEO
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@@ -997,6 +1009,7 @@
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fz = ZEO
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@@ -1151,6 +1164,7 @@
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fx = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -1227,6 +1241,7 @@
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fy = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -1297,6 +1312,7 @@
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fz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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@@ -1401,6 +1417,7 @@
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fxz = ZEO
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fyz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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@@ -1576,6 +1593,7 @@
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fxx = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -1643,6 +1661,7 @@
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fyy = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -1712,6 +1731,7 @@
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fzz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do j=1,ex(2)-1
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@@ -1781,6 +1801,7 @@
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fxy = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -1851,6 +1872,7 @@
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fxz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -1919,6 +1941,7 @@
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fyz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -2011,6 +2034,7 @@
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fy = ZEO
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fz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -2127,6 +2151,7 @@
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fx = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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||||
do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -2212,6 +2237,7 @@
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fy = ZEO
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||||
!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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||||
do j=1,ex(2)-1
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||||
do i=1,ex(1)-1
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@@ -2288,6 +2314,7 @@
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fz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -2406,6 +2433,7 @@
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fxz = ZEO
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fyz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -2593,6 +2621,7 @@
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fxx = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -2665,6 +2694,7 @@
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fyy = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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||||
do j=1,ex(2)-1
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||||
do i=1,ex(1)-1
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@@ -2740,6 +2770,7 @@
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fzz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -2815,6 +2846,7 @@
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fxy = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -2895,6 +2927,7 @@
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fxz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -2973,6 +3006,7 @@
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fyz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -3080,6 +3114,7 @@
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fy = ZEO
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fz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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||||
do i=1,ex(1)-1
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@@ -3216,6 +3251,7 @@
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fx = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -3311,6 +3347,7 @@
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fy = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -3395,6 +3432,7 @@
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fz = ZEO
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||||
!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -3530,6 +3568,7 @@
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fxz = ZEO
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fyz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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||||
do i=1,ex(1)-1
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@@ -3802,6 +3841,7 @@
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fxx = ZEO
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||||
!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
|
||||
do k=1,ex(3)-1
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||||
do j=1,ex(2)-1
|
||||
do i=1,ex(1)-1
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@@ -3883,6 +3923,7 @@
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fyy = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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||||
do j=1,ex(2)-1
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||||
do i=1,ex(1)-1
|
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@@ -3967,6 +4008,7 @@
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fzz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
|
||||
do k=1,ex(3)-1
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||||
do j=1,ex(2)-1
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||||
do i=1,ex(1)-1
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@@ -4051,6 +4093,7 @@
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fxy = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
|
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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@@ -4153,6 +4196,7 @@
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fxz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
|
||||
do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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||||
do i=1,ex(1)-1
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||||
@@ -4253,6 +4297,7 @@
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fyz = ZEO
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!$omp parallel do collapse(3) schedule(static)
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do k=1,ex(3)-1
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do j=1,ex(2)-1
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do i=1,ex(1)-1
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